某个黑夜一名间谍潜入日本警察机关企图盗取一份机密文件这份文件内容中含有英国MI6德国BDN美国CIA甚至还有FBI等各国谍报机构的相关人员名单千钧一发之际安室透率领的日本公安赶到间谍夺车逃跑高速公路大桥上上演激烈追逐战其他的车辆也被卷入其中眼看要酿成惨重事故的瞬间间谍的车被FBI赤井秀一用来复枪射中从大桥坠入海中翌日柯南等人来到东都水族馆游玩他们在巨大摩天轮底下发觉了一位独自一人又负伤的漂亮女子认真一看她的两只眼睛的瞳孔颜色不一样也确实是俗称的阴阳眼但是这位女子差不多是连自己名字都不记得的失忆状态带的手机也差不多损坏为了关心她寻回经历柯南等人约好了和她同行没想到这一切都被贝尔摩德背地监视着……