就快放暑假了，小学生上原康一在放学回家的路上捡到一块大石头。他把石头带回了家，没想到用水一洗，里面竟跳出一只小河童来。小河童对他“咕”的叫了一声，因此康一就给它取名为“小咕”。　　小咕会讲人类的语言，几百年来他一直被埋在在地下。康一特不快就和小咕成了好朋友，他们一起洗澡，一起吃饭，一起睡觉。而其它家庭成员也同意了小咕，小河童成了上原一家的隐秘。　　一天，小咕提出想回家和伙伴们在一起。康一为了让小咕了解不处的世界，悄悄把它带了出去。小咕发觉环境差不多面目全非，大吃了一惊，那个不适合就河童生存的地点全然就寻不到伙伴。看到小咕难过，康一也不行受。他和小咕一起外出旅行，来到了还保存着河童传讲的远野县。两人在漂亮的大自然中寻到了适合河童生活的地点，小咕愉快地在清亮的河里游了起来，康一也为它欢乐。但是，在那个地点也如何都寻不到其它河童。康一听到村民们讲“抓住一只河童能得一千万呢！”，赶忙带着小咕离开了那儿。　　回到家，康一讶异地撞见了一个小报记者。原来那人听讲上原家养着一只河童，一定要拍照。小咕的隐秘终于被大伙儿明白了。康一的爸爸被公司勒令一定要让河童上电视。为了上原一家，小咕承诺参加电视节目。然而在到场嘉宾里，它看到了一个长得特不像杀父凶手的人。就在小咕被恐惧包围的时候，电视节目现场发生了意外。它舍命逃到了不处，然而不管跑到哪里都会看到黑压压的人群。　　为了摆脱让它可怕的人类，小咕爬上了东京塔。夏季的烈日照得它精疲力竭。小咕俯瞰着都市，独自低语道：“哪里都寻不到一个安静的地点，那个地点是人类的窝。我差不多不行了。我要去爸爸那儿……”