大雄与同学们为了暑假作业到图书馆去寻有关海的资料，无意中看见《宝岛》这本书籍后感到对寻宝一事的向往，因此由哆啦A梦的道具“寻宝地图”中无意刺探到金银岛，因此与哆啦A梦就怂恿胖虎、小夫与静香一起加入那个冒险，向金银岛动身。到达岛上后为了增加气氛，因此由哆啦A梦拿出“传讲复原机”来增添冒险气氛。但不明白为何突然引起时空的异变，时空错乱将他们转移到17世纪的加勒比海上，同时卷入海盗之间的斗争，不但大雄与大伙儿失散了，哆啦A梦还甚至遗失了四次元口袋。而大雄在混乱之中被粉红色海豚“露菲”给救到岛上，同时结识了单独在岛上生活的青年“杰克”。另一方面，哆啦A梦们被当代横跨七个海域的海盗“吉特船长”与其朋友“科尔特船长”的女儿“贝蒂”挽救，同时还得到他们的关心一同前往传讲中的宝岛去救大雄。后来还发觉原来金银岛是以后世界“科隆博士”与“卡修”等人的隐秘基地，在金银岛上将生物改造成凶暴特性来贩卖的恶人集团。哆啦A梦们是否能顺利的与大雄会合？他们是否能够阻止卡修那个犯罪集团的打算呢？