工藤新一小栗旬这晚收到挑战书称将有他的同学在修学旅行的船上被绑架若新一不能爱护好同学须让出高中生名侦探的称号新一本对修学旅行没兴趣这封信令他次日赶到学校与小兰黒川智花园子岩佐真悠子及班里另外约30名同学会合众人刚登上旅行用船新一即把目光投向代理班主任北岛慎吾导游西田麻衣船长东邦夫松重丰及船员南田恭介西村和彦等人时刻保持着警惕但园子仍神不知鬼不觉失踪着手调查尚无头绪他再接绑架预告电话……